Protein–RNA interactions for Protein: Q12462

PEX11, Peroxisomal membrane protein PMP27, yeastyeast

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PEX11Q12462 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt3.97□□□□□ -1.77
PEX11Q12462 ARO80YDR421W 2853 nt3.97□□□□□ -1.77
PEX11Q12462 TRE1YPL176C 2352 nt3.97□□□□□ -1.77
PEX11Q12462 HUL4YJR036C 2679 nt3.97□□□□□ -1.77
PEX11Q12462 PMC1YGL006W 3522 nt3.96□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 MDR1YGR100W 2853 nt3.96□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 MAC1YMR021C 1254 nt3.96□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 FAS2YPL231W 5664 nt3.96□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 FAR8YMR029C 1572 nt3.95□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 HMLALPHA1YCL066W 528 nt3.95□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 MATALPHA1YCR040W 528 nt3.95□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 YHR112CYHR112C 1137 nt3.95□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 PAU17YLL025W 375 nt3.95□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 YNR061CYNR061C 660 nt3.95□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 CDC15YAR019C 2925 nt3.95□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 TRF5YNL299W 1929 nt3.95□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 AIP1YMR092C 1848 nt3.95□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 HOT1YMR172W 2160 nt3.95□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 LDB17YDL146W 1476 nt3.94□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 NBP2YDR162C 711 nt3.94□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 SPR28YDR218C 1272 nt3.94□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 YML119WYML119W 1074 nt3.94□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 RFA2YNL312W 822 nt3.94□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 YPL162CYPL162C 822 nt3.94□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 SKM1YOL113W 1968 nt3.94□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 YGR266WYGR266W 2106 nt3.94□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 ALG9YNL219C 1668 nt3.94□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 PTA1YAL043C 2358 nt3.94□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 PFK1YGR240C 2964 nt3.93□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 USA1YML029W 2517 nt3.93□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 LTV1YKL143W 1392 nt3.93□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 SSL1YLR005W 1386 nt3.93□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 YBR225WYBR225W 2703 nt3.93□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 YCR085WYCR085W 354 nt3.93□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 YDR230WYDR230W 348 nt3.93□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.93□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.93□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.93□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.93□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.93□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.93□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.93□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.93□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.93□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.93□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 DAM1YGR113W 1032 nt3.93□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 YHL049CYHL049C 816 nt3.93□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 FLD1YLR404W 858 nt3.93□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 RSF1YMR030W 1131 nt3.93□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 SHE1YBL031W 1017 nt3.93□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 RPL18BYNL301C 561 nt3.93□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 LOS1YKL205W 3303 nt3.93□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 CHL1YPL008W 2586 nt3.93□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 PHO84YML123C 1764 nt3.92□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 GDE1YPL110C 3672 nt3.92□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 THI20YOL055C 1656 nt3.92□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 MSW1YDR268W 1140 nt3.92□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 YHR145CYHR145C 357 nt3.92□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 YHR173CYHR173C 339 nt3.92□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 BAT2YJR148W 1131 nt3.92□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 GTR1YML121W 933 nt3.92□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 TOM40YMR203W 1164 nt3.92□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 SIW14YNL032W 846 nt3.92□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 YNL228WYNL228W 777 nt3.92□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt3.92□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 GSM1YJL103C 1857 nt3.92□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 MDM30YLR368W 1797 nt3.91□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 MTR10YOR160W 2919 nt3.91□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 MRE11YMR224C 2079 nt3.91□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 PDR12YPL058C 4536 nt3.91□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 HOM3YER052C 1584 nt3.91□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 HIS5YIL116W 1158 nt3.91□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 ASC1YMR116C 960 nt3.91□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 YOR292CYOR292C 930 nt3.91□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 TRM44YPL030W 1704 nt3.91□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 YPL113CYPL113C 1191 nt3.91□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 RIA1YNL163C 3333 nt3.91□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 SSH1YBR283C 1473 nt3.91□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 ECM32YER176W 3366 nt3.9□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 UPC2YDR213W 2742 nt3.9□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 TPA1YER049W 1935 nt3.9□□□□□ -1.78
PEX11Q12462 YKE4YIL023C 1041 nt3.9□□□□□ -1.79
PEX11Q12462 YJL218WYJL218W 591 nt3.9□□□□□ -1.79
PEX11Q12462 CUS2YNL286W 858 nt3.9□□□□□ -1.79
PEX11Q12462 MED4YOR174W 855 nt3.9□□□□□ -1.79
PEX11Q12462 YND1YER005W 1893 nt3.9□□□□□ -1.79
PEX11Q12462 ORM2YLR350W 651 nt3.89□□□□□ -1.79
PEX11Q12462 MCM1YMR043W 861 nt3.89□□□□□ -1.79
PEX11Q12462 CWC25YNL245C 540 nt3.89□□□□□ -1.79
PEX11Q12462 SRB6YBR253W 366 nt3.89□□□□□ -1.79
PEX11Q12462 MDM34YGL219C 1380 nt3.89□□□□□ -1.79
PEX11Q12462 VBA2YBR293W 1425 nt3.88□□□□□ -1.79
PEX11Q12462 EXO70YJL085W 1872 nt3.88□□□□□ -1.79
PEX11Q12462 BBC1YJL020C 3474 nt3.88□□□□□ -1.79
PEX11Q12462 YDR274CYDR274C 372 nt3.88□□□□□ -1.79
PEX11Q12462 YDR445CYDR445C 408 nt3.88□□□□□ -1.79
PEX11Q12462 IES6YEL044W 501 nt3.88□□□□□ -1.79
PEX11Q12462 RPL8AYHL033C 771 nt3.88□□□□□ -1.79
PEX11Q12462 YBL036CYBL036C 774 nt3.88□□□□□ -1.79
PEX11Q12462 ASI2YNL159C 870 nt3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 43.7 ms