Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 CRT10YOL063C 2874 nt4.25□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 BUD7YOR299W 2241 nt4.25□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 TFC7YOR110W 1308 nt4.24□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 MDM38YOL027C 1722 nt4.24□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 IOC4YMR044W 1428 nt4.24□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 YFL064CYFL064C 525 nt4.24□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 CIR1YGR207C 786 nt4.24□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 HRT3YLR097C 1035 nt4.24□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 ERD2YBL040C 660 nt4.24□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 MFM1YPL060W 1242 nt4.24□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 BBP1YPL255W 1158 nt4.24□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 YSA1YBR111C 696 nt4.24□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 MNT2YGL257C 1677 nt4.24□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 MIH1YMR036C 1665 nt4.24□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 RKM3YBR030W 1659 nt4.24□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 IMD3YLR432W 1572 nt4.23□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 CDC9YDL164C 2268 nt4.23□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 ARX1YDR101C 1782 nt4.23□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 snR63snR63 255 nt4.23□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 THI5YFL058W 1023 nt4.23□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 YGR219WYGR219W 342 nt4.23□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 YRA2YKL214C 612 nt4.23□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 RPS1BYML063W 768 nt4.23□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 HEK2YBL032W 1146 nt4.23□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 YMR084WYMR084W 789 nt4.23□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 THI12YNL332W 1023 nt4.23□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 SPS4YOR313C 1017 nt4.23□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 CNS1YBR155W 1158 nt4.23□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 HMS1YOR032C 1305 nt4.22□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 COT1YOR316C 1320 nt4.22□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 PUF2YPR042C 3228 nt4.22□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 YJR015WYJR015W 1533 nt4.22□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 FAP1YNL023C 2898 nt4.22□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 SEH1YGL100W 1050 nt4.22□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 SDT1YGL224C 843 nt4.22□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 YKL023WYKL023W 834 nt4.22□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 ATG8YBL078C 354 nt4.22□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 MAP2YBL091C 1266 nt4.22□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 AIM39YOL053W 1188 nt4.22□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 VPS21YOR089C 633 nt4.22□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 CDC6YJL194W 1542 nt4.21□□□□□ -1.73
VAM3Q12241 OAF1YAL051W 3144 nt4.21□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 YDR134CYDR134C 411 nt4.21□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt4.21□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 CLB5YPR120C 1308 nt4.21□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 SRO9YCL037C 1305 nt4.21□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 RTK1YDL025C 1863 nt4.2□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 NAM9YNL137C 1461 nt4.2□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 YDL026WYDL026W 312 nt4.2□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 YEL045CYEL045C 426 nt4.2□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 DCV1YFR012W 609 nt4.2□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 MRPL6YHR147C 645 nt4.2□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 RNA1YMR235C 1224 nt4.2□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 MDM12YOL009C 816 nt4.2□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 MED7YOL135C 669 nt4.2□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 TRS33YOR115C 807 nt4.2□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 PGM2YMR105C 1710 nt4.2□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 PHO84YML123C 1764 nt4.19□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 SLM5YCR024C 1479 nt4.19□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 RCM1YNL022C 1473 nt4.19□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 YMR102CYMR102C 2505 nt4.19□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 RMR1YGL250W 726 nt4.19□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 YKL177WYKL177W 339 nt4.19□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt4.19□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 RAD10YML095C 633 nt4.19□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 CBP3YPL215W 1008 nt4.19□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.19□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 MPS3YJL019W 2049 nt4.18□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 TFB3YDR460W 966 nt4.18□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 SAE3YHR079C-A 276 nt4.18□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 NSG1YHR133C 876 nt4.18□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 ORM2YLR350W 651 nt4.18□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 YMR085WYMR085W 1299 nt4.18□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 TRM10YOL093W 882 nt4.18□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 GPI2YPL076W 843 nt4.18□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 YDC1YPL087W 954 nt4.18□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 PEX29YDR479C 1665 nt4.18□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 YHB1YGR234W 1200 nt4.17□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt4.17□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 PRM10YJL108C 1152 nt4.17□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 GCD7YLR291C 1146 nt4.17□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 SPO20YMR017W 1194 nt4.17□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt4.17□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 COG5YNL051W 1212 nt4.17□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 MRPL37YBR268W 318 nt4.17□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 TEL1YBL088C 8364 nt4.17□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 GIP4YAL031C 2283 nt4.17□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 BOI2YER114C 3123 nt4.17□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 GRC3YLL035W 1899 nt4.16□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 YCR101CYCR101C 549 nt4.16□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 MSS2YDL107W 1056 nt4.16□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 SCM3YDL139C 672 nt4.16□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 BCP1YDR361C 852 nt4.16□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 RPN12YFR052W 825 nt4.16□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt4.16□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 YGR153WYGR153W 654 nt4.16□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 YAE1YJR067C 426 nt4.16□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 KTR2YKR061W 1278 nt4.16□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 CDC73YLR418C 1182 nt4.16□□□□□ -1.74
VAM3Q12241 CUZ1YNL155W 825 nt4.16□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.4 ms