Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 CBF5YLR175W 1452 nt4.06□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 DAS2YDR020C 699 nt4.06□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 YBR219CYBR219C 384 nt4.06□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 FMP25YLR077W 1752 nt4.06□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 SUL2YLR092W 2682 nt4.06□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 NMD3YHR170W 1557 nt4.06□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 MLH2YLR035C 2088 nt4.06□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 BCK2YER167W 2556 nt4.06□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 YMR221CYMR221C 1515 nt4.05□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 SRP72YPL210C 1923 nt4.05□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 ABP140YOR239W 1887 nt4.05□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 YDL172CYDL172C 480 nt4.05□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt4.05□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 MRPL25YGR076C 474 nt4.05□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 ATP14YLR295C 375 nt4.05□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 RGP1YDR137W 1992 nt4.05□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 CDC6YJL194W 1542 nt4.05□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 CDC9YDL164C 2268 nt4.05□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 RPB2YOR151C 3675 nt4.04□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 PCL6YER059W 1263 nt4.04□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 RPL24AYGL031C 468 nt4.04□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 HIS6YIL020C 786 nt4.04□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 SYN8YAL014C 768 nt4.04□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 RPL14AYKL006W 417 nt4.04□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 PEX22YAL055W 543 nt4.04□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 MRPL4YLR439W 960 nt4.04□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 SUI1YNL244C 327 nt4.04□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 ALG5YPL227C 1005 nt4.04□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 TIF5YPR041W 1218 nt4.04□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 ADP1YCR011C 3150 nt4.04□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 FAA1YOR317W 2103 nt4.04□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 SSH4YKL124W 1740 nt4.04□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 TFA1YKL028W 1449 nt4.04□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 RSC3YDR303C 2658 nt4.03□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 AAD6YFL056C 639 nt4.03□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt4.03□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt4.03□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt4.03□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt4.03□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt4.03□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt4.03□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt4.03□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 IES3YLR052W 753 nt4.03□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 RCL1YOL010W 1104 nt4.03□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 MET12YPL023C 1974 nt4.03□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 RSC30YHR056C 2652 nt4.03□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 RPO31YOR116C 4383 nt4.03□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 PTA1YAL043C 2358 nt4.03□□□□□ -1.76
MSH5Q12175 ALG6YOR002W 1635 nt4.03□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 YDR444WYDR444W 2064 nt4.02□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 INO2YDR123C 915 nt4.02□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 SKI8YGL213C 1194 nt4.02□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt4.02□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 IDP2YLR174W 1239 nt4.02□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 PRE7YBL041W 726 nt4.02□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 YPT53YNL093W 663 nt4.02□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 FYV5YCL058C 459 nt4.02□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 PPZ1YML016C 2079 nt4.01□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 GGA1YDR358W 1674 nt4.01□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 MRPL7YDR237W 879 nt4.01□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 YIL171WYIL171W 330 nt4.01□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 MTC2YKL098W 1074 nt4.01□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 TPP1YMR156C 717 nt4.01□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 SPS19YNL202W 879 nt4.01□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 CKB2YOR039W 777 nt4.01□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 GDT1YBR187W 843 nt4.01□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 RPP1AYDL081C 321 nt4□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 RPS13YDR064W 456 nt4□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 YGL088WYGL088W 366 nt4□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 COX4YGL187C 468 nt4□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 SYF2YGR129W 648 nt4□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 SOP4YJL192C 705 nt4□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 NSE1YLR007W 1011 nt4□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 PRM9YAR031W 897 nt4□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 SEC72YLR292C 582 nt4□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 YBL029WYBL029W 1131 nt4□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 YMR130WYMR130W 909 nt4□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 URE2YNL229C 1065 nt4□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 REX4YOL080C 870 nt4□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 RAD17YOR368W 1206 nt4□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 YPL073CYPL073C 486 nt4□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 IDI1YPL117C 867 nt4□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 NRG2YBR066C 663 nt4□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 ENT1YDL161W 1365 nt4□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 CEG1YGL130W 1380 nt4□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 MST1YKL194C 1389 nt4□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 YER077CYER077C 2067 nt3.99□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 ZRC1YMR243C 1329 nt3.99□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 NCR1YPL006W 3513 nt3.99□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 IOC2YLR095C 2439 nt3.99□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 MAL13YGR288W 1422 nt3.99□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 TDA6YPR157W 1404 nt3.99□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 RHB1YCR027C 630 nt3.99□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 SPO74YGL170C 1242 nt3.99□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 VPS29YHR012W 849 nt3.99□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 ELO3YLR372W 1038 nt3.99□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt3.99□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 NIS1YNL078W 1224 nt3.99□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 LAS1YKR063C 1509 nt3.99□□□□□ -1.77
MSH5Q12175 VPS45YGL095C 1734 nt3.98□□□□□ -1.77
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