Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeast

Predictions only

Length 290 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TY3A-G	Q12173	AAD6	YFL056C	639 nt		4.59	□□□□□ -1.67
TY3A-G	Q12173	ERG20	YJL167W	1059 nt		4.59	□□□□□ -1.67
TY3A-G	Q12173	MBR1	YKL093W	1020 nt		4.59	□□□□□ -1.67
TY3A-G	Q12173	YKL162C-A	YKL162C-A	153 nt		4.59	□□□□□ -1.67
TY3A-G	Q12173	MDM30	YLR368W	1797 nt		4.59	□□□□□ -1.67
TY3A-G	Q12173	FLD1	YLR404W	858 nt		4.59	□□□□□ -1.67
TY3A-G	Q12173	CEX1	YOR112W	2286 nt		4.58	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	MDM34	YGL219C	1380 nt		4.58	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	MSW1	YDR268W	1140 nt		4.58	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	RPL34A	YER056C-A	366 nt		4.58	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	LSB1	YGR136W	726 nt		4.58	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	FUR1	YHR128W	651 nt		4.58	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	YJL215C	YJL215C	360 nt		4.58	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	YML119W	YML119W	1074 nt		4.58	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	MRM1	YOR201C	1239 nt		4.58	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	SRB6	YBR253W	366 nt		4.58	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	TCB3	YML072C	4638 nt		4.58	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	SGN1	YIR001C	753 nt		4.57	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	BAT2	YJR148W	1131 nt		4.57	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	EOS1	YNL080C	1101 nt		4.57	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	TYW1	YPL207W	2433 nt		4.57	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	VHC1	YBR235W	3363 nt		4.57	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	CDC48	YDL126C	2508 nt		4.56	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	ZPR1	YGR211W	1461 nt		4.56	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	FMP48	YGR052W	1110 nt		4.56	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	VPS69	YPR087W	321 nt		4.56	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	MDR1	YGR100W	2853 nt		4.55	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	LTV1	YKL143W	1392 nt		4.55	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	LAP3	YNL239W	1365 nt		4.55	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	BSC1	YDL037C	987 nt		4.55	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	RPB7	YDR404C	516 nt		4.55	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	IGO2	YHR132W-A	396 nt		4.55	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	YRA2	YKL214C	612 nt		4.55	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	YIM1	YMR152W	1098 nt		4.55	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	IMD2	YHR216W	1572 nt		4.55	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	THI7	YLR237W	1797 nt		4.55	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	GAS4	YOL132W	1416 nt		4.55	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	CTT1	YGR088W	1689 nt		4.54	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	HOM3	YER052C	1584 nt		4.54	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	OCA4	YCR095C	1089 nt		4.54	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	snR7-S	snR7-S	179 nt		4.54	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	UBC6	YER100W	753 nt		4.54	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	YHR173C	YHR173C	339 nt		4.54	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	LOH1	YJL038C	660 nt		4.54	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	PER33	YLR064W	822 nt		4.54	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	GIP4	YAL031C	2283 nt		4.54	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	YER158C	YER158C	1722 nt		4.53	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	TFB3	YDR460W	966 nt		4.53	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	MRP4	YHL004W	1185 nt		4.53	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	YIL171W	YIL171W	330 nt		4.53	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	CDC42	YLR229C	576 nt		4.53	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	ORM2	YLR350W	651 nt		4.53	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	NOP13	YNL175C	1212 nt		4.53	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	YOR034C-A	YOR034C-A	243 nt		4.53	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	TGS1	YPL157W	948 nt		4.53	□□□□□ -1.68
TY3A-G	Q12173	EUG1	YDR518W	1554 nt		4.53	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	HSP82	YPL240C	2130 nt		4.52	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	RPS14A	YCR031C	414 nt		4.52	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	NAT2	YGR147C	867 nt		4.52	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	DPH1	YIL103W	1278 nt		4.52	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	CYC1	YJR048W	330 nt		4.52	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	HEK2	YBL032W	1146 nt		4.52	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	MFM1	YPL060W	1242 nt		4.52	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	YPL113C	YPL113C	1191 nt		4.52	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	SEC2	YNL272C	2280 nt		4.52	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	GSM1	YJL103C	1857 nt		4.52	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	DAN1	YJR150C	897 nt		4.51	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	PUT2	YHR037W	1728 nt		4.51	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	LRG1	YDL240W	3054 nt		4.51	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	VID27	YNL212W	2349 nt		4.5	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	YGR027W-B	YGR027W-B	5268 nt		4.5	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	YLR227W-B	YLR227W-B	5268 nt		4.5	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	YPR158C-D	YPR158C-D	5268 nt		4.5	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	YGR011W	YGR011W	327 nt		4.5	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	YHL049C	YHL049C	816 nt		4.5	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	GPP1	YIL053W	753 nt		4.5	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	PML1	YLR016C	615 nt		4.5	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	USA1	YML029W	2517 nt		4.5	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	HOT1	YMR172W	2160 nt		4.5	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	TMN2	YDR107C	2019 nt		4.5	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	CDC9	YDL164C	2268 nt		4.49	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	LOS1	YKL205W	3303 nt		4.49	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	POL12	YBL035C	2118 nt		4.49	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	AVT1	YJR001W	1809 nt		4.49	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	THI20	YOL055C	1656 nt		4.49	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	YDR274C	YDR274C	372 nt		4.49	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	HIS6	YIL020C	786 nt		4.49	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	AIM26	YKL037W	357 nt		4.49	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	RDN5-1	RDN5-1	121 nt		4.49	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	HMX1	YLR205C	954 nt		4.49	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	RDN5-6	RDN5-6	121 nt		4.49	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	LAS1	YKR063C	1509 nt		4.49	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	IZH3	YLR023C	1632 nt		4.49	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	FMP30	YPL103C	1407 nt		4.48	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	ADP1	YCR011C	3150 nt		4.48	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	SAE3	YHR079C-A	276 nt		4.48	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	LNP1	YHR192W	837 nt		4.48	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	ASI2	YNL159C	870 nt		4.48	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	GDE1	YPL110C	3672 nt		4.48	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	GLN4	YOR168W	2430 nt		4.47	□□□□□ -1.69

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