Protein–RNA interactions for Protein: Q08474

VAM10, Vacuolar morphogenesis protein 10, yeastyeast

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM10Q08474 TPO2YGR138C 1845 nt2.98□□□□□ -1.93
VAM10Q08474 ARO80YDR421W 2853 nt2.98□□□□□ -1.93
VAM10Q08474 HUL4YJR036C 2679 nt2.97□□□□□ -1.93
VAM10Q08474 PRP31YGR091W 1485 nt2.97□□□□□ -1.93
VAM10Q08474 EFM2YBR271W 1260 nt2.97□□□□□ -1.93
VAM10Q08474 PTA1YAL043C 2358 nt2.97□□□□□ -1.93
VAM10Q08474 TRS85YDR108W 2097 nt2.97□□□□□ -1.93
VAM10Q08474 ARG4YHR018C 1392 nt2.97□□□□□ -1.93
VAM10Q08474 MST1YKL194C 1389 nt2.97□□□□□ -1.93
VAM10Q08474 CHL1YPL008W 2586 nt2.97□□□□□ -1.93
VAM10Q08474 VHS3YOR054C 2025 nt2.97□□□□□ -1.93
VAM10Q08474 GPI18YBR004C 1302 nt2.96□□□□□ -1.93
VAM10Q08474 CBP1YJL209W 1965 nt2.96□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 SSB1YDL229W 1842 nt2.96□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 STB2YMR053C 2553 nt2.96□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 YDL228CYDL228C 642 nt2.96□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 AIM7YDR063W 450 nt2.96□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 YHR112CYHR112C 1137 nt2.96□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 SEC72YLR292C 582 nt2.96□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 DSC2YOL073C 969 nt2.96□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 YOR131CYOR131C 657 nt2.96□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 YBR139WYBR139W 1527 nt2.96□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 YCF1YDR135C 4548 nt2.96□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 TGL4YKR089C 2733 nt2.96□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 SBE2YDR351W 2595 nt2.96□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 FRE7YOL152W 1863 nt2.95□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 SPC19YDR201W 498 nt2.95□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 YDR230WYDR230W 348 nt2.95□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 CAF16YFL028C 870 nt2.95□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 RFU1YLR073C 603 nt2.95□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 YMR315WYMR315W 1050 nt2.95□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 FSH3YOR280C 801 nt2.95□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 STP22YCL008C 1158 nt2.95□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 KRE29YER038C 1395 nt2.95□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 PTR2YKR093W 1806 nt2.95□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 YBR225WYBR225W 2703 nt2.95□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 DIT2YDR402C 1470 nt2.95□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 ECM32YER176W 3366 nt2.95□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 PSY4YBL046W 1326 nt2.94□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 SEC2YNL272C 2280 nt2.94□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 LOS1YKL205W 3303 nt2.94□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 PHO87YCR037C 2772 nt2.94□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 DPB4YDR121W 591 nt2.94□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 NBP2YDR162C 711 nt2.94□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 YDR274CYDR274C 372 nt2.94□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 MAD2YJL030W 591 nt2.94□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 PER33YLR064W 822 nt2.94□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 YMR130WYMR130W 909 nt2.94□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 YBL059WYBL059W 582 nt2.94□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 YNL228WYNL228W 777 nt2.94□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 RMI1YPL024W 726 nt2.94□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 GAL11YOL051W 3246 nt2.94□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 BBC1YJL020C 3474 nt2.94□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 IFM1YOL023W 2031 nt2.93□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 VMA1YDL185W 3216 nt2.93□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 TCB3YML072C 4638 nt2.93□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 MDM34YGL219C 1380 nt2.93□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 EOS1YNL080C 1101 nt2.93□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 MDM12YOL009C 816 nt2.93□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 MED4YOR174W 855 nt2.93□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 SNF8YPL002C 702 nt2.93□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 snR3snR3 194 nt2.93□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 SLX1YBR228W 915 nt2.93□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 USA1YML029W 2517 nt2.93□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 SRP72YPL210C 1923 nt2.93□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 MPH2YDL247W 1830 nt2.93□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 RRN11YML043C 1524 nt2.93□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 PRP9YDL030W 1593 nt2.92□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 TRE1YPL176C 2352 nt2.92□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 IRC22YEL001C 678 nt2.92□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 UBC8YEL012W 657 nt2.92□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 BUD16YEL029C 939 nt2.92□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt2.92□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 ATG17YLR423C 1254 nt2.92□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 NOP13YNL175C 1212 nt2.92□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 HEM15YOR176W 1182 nt2.92□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 RET3YPL010W 570 nt2.92□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 GDT1YBR187W 843 nt2.92□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt2.92□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 ECM22YLR228C 2445 nt2.92□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 TDA11YHR159W 1515 nt2.92□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 LDB17YDL146W 1476 nt2.91□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 RCM1YNL022C 1473 nt2.91□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 BSC5YNR069C 1470 nt2.91□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 KIN4YOR233W 2403 nt2.91□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 MRE11YMR224C 2079 nt2.91□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 AHA1YDR214W 1053 nt2.91□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 RTT103YDR289C 1230 nt2.91□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 TYS1YGR185C 1185 nt2.91□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt2.91□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 RPC19YNL113W 429 nt2.91□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt2.91□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 CDC14YFR028C 1656 nt2.91□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 DBP3YGL078C 1572 nt2.91□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 MNN1YER001W 2289 nt2.9□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 SMP1YBR182C 1359 nt2.9□□□□□ -1.94
VAM10Q08474 SSA2YLL024C 1920 nt2.9□□□□□ -1.95
VAM10Q08474 UTP11YKL099C 753 nt2.9□□□□□ -1.95
VAM10Q08474 KTR2YKR061W 1278 nt2.9□□□□□ -1.95
VAM10Q08474 YMR085WYMR085W 1299 nt2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.2 ms