Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAX8Q06710 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms