Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBQ06643 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBQ06643 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBQ06643 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBQ06643 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBQ06643 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBQ06643 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBQ06643 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBQ06643 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LTBQ06643 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LTBQ06643 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LTBQ06643 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LTBQ06643 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LTBQ06643 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LTBQ06643 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LTBQ06643 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LTBQ06643 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTBQ06643 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTBQ06643 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTBQ06643 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTBQ06643 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTBQ06643 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTBQ06643 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTBQ06643 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTBQ06643 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTBQ06643 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTBQ06643 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBQ06643 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBQ06643 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBQ06643 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBQ06643 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBQ06643 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBQ06643 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBQ06643 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBQ06643 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBQ06643 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTBQ06643 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTBQ06643 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LTBQ06643 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBQ06643 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBQ06643 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBQ06643 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBQ06643 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBQ06643 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBQ06643 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBQ06643 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBQ06643 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBQ06643 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBQ06643 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBQ06643 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBQ06643 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBQ06643 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBQ06643 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBQ06643 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBQ06643 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBQ06643 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBQ06643 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBQ06643 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBQ06643 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBQ06643 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBQ06643 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBQ06643 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBQ06643 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBQ06643 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBQ06643 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBQ06643 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBQ06643 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBQ06643 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBQ06643 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBQ06643 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBQ06643 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBQ06643 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBQ06643 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBQ06643 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBQ06643 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBQ06643 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBQ06643 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBQ06643 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBQ06643 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBQ06643 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LTBQ06643 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LTBQ06643 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LTBQ06643 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LTBQ06643 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LTBQ06643 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LTBQ06643 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LTBQ06643 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBQ06643 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBQ06643 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBQ06643 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBQ06643 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBQ06643 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBQ06643 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBQ06643 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBQ06643 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBQ06643 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBQ06643 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBQ06643 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBQ06643 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBQ06643 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms