Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms