Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTDSPL2Q05D32 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms