Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCDQ05655 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKCDQ05655 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms