Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPN12Q05209 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms