Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms