Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PAX5Q02548 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAX5Q02548 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX5Q02548 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms