Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BNC1Q01954 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms