Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CLTCQ00610 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CLTCQ00610 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLTCQ00610 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms