Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCCQ00597 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCCQ00597 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms