Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms