Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXO4P98177 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXO4P98177 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXO4P98177 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXO4P98177 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXO4P98177 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXO4P98177 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXO4P98177 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXO4P98177 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXO4P98177 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXO4P98177 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXO4P98177 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXO4P98177 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXO4P98177 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXO4P98177 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms