Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNB1P98172 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms