Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED6P86452 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZBED6P86452 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZBED6P86452 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ZBED6P86452 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED6P86452 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED6P86452 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED6P86452 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED6P86452 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED6P86452 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED6P86452 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED6P86452 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED6P86452 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED6P86452 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED6P86452 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED6P86452 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED6P86452 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED6P86452 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED6P86452 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED6P86452 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED6P86452 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED6P86452 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED6P86452 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED6P86452 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED6P86452 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED6P86452 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED6P86452 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED6P86452 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED6P86452 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms