Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TMF1P82094 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TMF1P82094 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TMF1P82094 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TMF1P82094 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TMF1P82094 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TMF1P82094 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TMF1P82094 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
TMF1P82094 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TMF1P82094 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
TMF1P82094 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
TMF1P82094 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TMF1P82094 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TMF1P82094 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TMF1P82094 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
TMF1P82094 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TMF1P82094 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TMF1P82094 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TMF1P82094 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TMF1P82094 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
TMF1P82094 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TMF1P82094 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TMF1P82094 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TMF1P82094 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TMF1P82094 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TMF1P82094 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TMF1P82094 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TMF1P82094 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TMF1P82094 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TMF1P82094 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TMF1P82094 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TMF1P82094 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TMF1P82094 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TMF1P82094 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TMF1P82094 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TMF1P82094 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TMF1P82094 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TMF1P82094 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TMF1P82094 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TMF1P82094 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TMF1P82094 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TMF1P82094 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TMF1P82094 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TMF1P82094 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TMF1P82094 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
TMF1P82094 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TMF1P82094 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TMF1P82094 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TMF1P82094 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TMF1P82094 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TMF1P82094 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TMF1P82094 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TMF1P82094 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TMF1P82094 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
TMF1P82094 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TMF1P82094 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TMF1P82094 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TMF1P82094 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TMF1P82094 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TMF1P82094 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TMF1P82094 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TMF1P82094 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TMF1P82094 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TMF1P82094 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TMF1P82094 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
TMF1P82094 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC31■■■□□ 2.55
TMF1P82094 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC31■■■□□ 2.55
TMF1P82094 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TMF1P82094 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TMF1P82094 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TMF1P82094 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TMF1P82094 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TMF1P82094 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TMF1P82094 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TMF1P82094 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TMF1P82094 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TMF1P82094 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TMF1P82094 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TMF1P82094 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TMF1P82094 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TMF1P82094 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TMF1P82094 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TMF1P82094 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TMF1P82094 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
TMF1P82094 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
TMF1P82094 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TMF1P82094 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TMF1P82094 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TMF1P82094 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TMF1P82094 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TMF1P82094 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
TMF1P82094 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TMF1P82094 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TMF1P82094 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TMF1P82094 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TMF1P82094 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TMF1P82094 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TMF1P82094 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TMF1P82094 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TMF1P82094 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms