Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELF3P78545 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELF3P78545 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELF3P78545 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELF3P78545 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELF3P78545 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELF3P78545 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELF3P78545 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ELF3P78545 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ELF3P78545 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ELF3P78545 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ELF3P78545 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ELF3P78545 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ELF3P78545 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ELF3P78545 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ELF3P78545 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ELF3P78545 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ELF3P78545 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELF3P78545 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELF3P78545 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELF3P78545 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELF3P78545 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELF3P78545 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELF3P78545 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELF3P78545 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELF3P78545 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELF3P78545 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ELF3P78545 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ELF3P78545 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ELF3P78545 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELF3P78545 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELF3P78545 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELF3P78545 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELF3P78545 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELF3P78545 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELF3P78545 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELF3P78545 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELF3P78545 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELF3P78545 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELF3P78545 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELF3P78545 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELF3P78545 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELF3P78545 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELF3P78545 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELF3P78545 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELF3P78545 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELF3P78545 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELF3P78545 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELF3P78545 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELF3P78545 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELF3P78545 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELF3P78545 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELF3P78545 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELF3P78545 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELF3P78545 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELF3P78545 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELF3P78545 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELF3P78545 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELF3P78545 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELF3P78545 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELF3P78545 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELF3P78545 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELF3P78545 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELF3P78545 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELF3P78545 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELF3P78545 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELF3P78545 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELF3P78545 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELF3P78545 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELF3P78545 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELF3P78545 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELF3P78545 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELF3P78545 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELF3P78545 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELF3P78545 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELF3P78545 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELF3P78545 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELF3P78545 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELF3P78545 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELF3P78545 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELF3P78545 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELF3P78545 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELF3P78545 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELF3P78545 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELF3P78545 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELF3P78545 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELF3P78545 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELF3P78545 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELF3P78545 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELF3P78545 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELF3P78545 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELF3P78545 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELF3P78545 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELF3P78545 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELF3P78545 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELF3P78545 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELF3P78545 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELF3P78545 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELF3P78545 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELF3P78545 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms