Protein–RNA interactions for Protein: P78358

CTAG1A, Cancer/testis antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAG1AP78358 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTAG1AP78358 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTAG1AP78358 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTAG1AP78358 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTAG1AP78358 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTAG1AP78358 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTAG1AP78358 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTAG1AP78358 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTAG1AP78358 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTAG1AP78358 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTAG1AP78358 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTAG1AP78358 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTAG1AP78358 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTAG1AP78358 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTAG1AP78358 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTAG1AP78358 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms