Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK2BP67870 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK2BP67870 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK2BP67870 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK2BP67870 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK2BP67870 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK2BP67870 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK2BP67870 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK2BP67870 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSNK2BP67870 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSNK2BP67870 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK2BP67870 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms