Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKP1P63208 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKP1P63208 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKP1P63208 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKP1P63208 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKP1P63208 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKP1P63208 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKP1P63208 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKP1P63208 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKP1P63208 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKP1P63208 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SKP1P63208 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKP1P63208 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKP1P63208 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKP1P63208 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SKP1P63208 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKP1P63208 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKP1P63208 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SKP1P63208 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKP1P63208 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKP1P63208 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKP1P63208 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP1P63208 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP1P63208 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP1P63208 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP1P63208 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP1P63208 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP1P63208 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP1P63208 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP1P63208 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP1P63208 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP1P63208 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP1P63208 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP1P63208 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP1P63208 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP1P63208 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP1P63208 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP1P63208 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP1P63208 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP1P63208 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP1P63208 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP1P63208 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP1P63208 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP1P63208 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP1P63208 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKP1P63208 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKP1P63208 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKP1P63208 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKP1P63208 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKP1P63208 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKP1P63208 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKP1P63208 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKP1P63208 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SKP1P63208 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKP1P63208 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKP1P63208 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKP1P63208 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SKP1P63208 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKP1P63208 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKP1P63208 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SKP1P63208 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SKP1P63208 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SKP1P63208 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SKP1P63208 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SKP1P63208 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKP1P63208 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKP1P63208 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKP1P63208 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SKP1P63208 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKP1P63208 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKP1P63208 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKP1P63208 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKP1P63208 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKP1P63208 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKP1P63208 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKP1P63208 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKP1P63208 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SKP1P63208 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SKP1P63208 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKP1P63208 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKP1P63208 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKP1P63208 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKP1P63208 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKP1P63208 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKP1P63208 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKP1P63208 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKP1P63208 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKP1P63208 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKP1P63208 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKP1P63208 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKP1P63208 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKP1P63208 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKP1P63208 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SKP1P63208 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SKP1P63208 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKP1P63208 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKP1P63208 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SKP1P63208 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKP1P63208 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKP1P63208 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms