Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2LP62875 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2LP62875 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2LP62875 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms