Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL23P62829 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL23P62829 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL23P62829 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL23P62829 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL23P62829 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL23P62829 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL23P62829 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL23P62829 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL23P62829 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL23P62829 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL23P62829 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL23P62829 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL23P62829 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL23P62829 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL23P62829 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL23P62829 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL23P62829 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL23P62829 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RPL23P62829 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RPL23P62829 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL23P62829 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL23P62829 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL23P62829 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL23P62829 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL23P62829 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL23P62829 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL23P62829 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL23P62829 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL23P62829 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL23P62829 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL23P62829 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL23P62829 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL23P62829 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL23P62829 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL23P62829 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL23P62829 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL23P62829 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL23P62829 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL23P62829 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL23P62829 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL23P62829 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL23P62829 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL23P62829 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL23P62829 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL23P62829 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL23P62829 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL23P62829 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL23P62829 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL23P62829 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL23P62829 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL23P62829 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL23P62829 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL23P62829 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL23P62829 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL23P62829 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL23P62829 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL23P62829 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL23P62829 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL23P62829 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL23P62829 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL23P62829 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL23P62829 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL23P62829 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL23P62829 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL23P62829 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL23P62829 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL23P62829 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL23P62829 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL23P62829 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL23P62829 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL23P62829 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL23P62829 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL23P62829 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL23P62829 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL23P62829 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL23P62829 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL23P62829 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL23P62829 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL23P62829 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL23P62829 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL23P62829 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL23P62829 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL23P62829 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL23P62829 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL23P62829 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL23P62829 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL23P62829 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL23P62829 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL23P62829 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL23P62829 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL23P62829 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL23P62829 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL23P62829 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL23P62829 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL23P62829 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL23P62829 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL23P62829 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL23P62829 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL23P62829 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms