Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB11AP62491 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms