Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RPS29P62273 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RPS29P62273 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RPS29P62273 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RPS29P62273 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RPS29P62273 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RPS29P62273 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RPS29P62273 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RPS29P62273 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RPS29P62273 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RPS29P62273 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RPS29P62273 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RPS29P62273 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RPS29P62273 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RPS29P62273 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RPS29P62273 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RPS29P62273 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RPS29P62273 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RPS29P62273 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RPS29P62273 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RPS29P62273 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RPS29P62273 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RPS29P62273 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RPS29P62273 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RPS29P62273 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RPS29P62273 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RPS29P62273 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RPS29P62273 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
RPS29P62273 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RPS29P62273 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RPS29P62273 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RPS29P62273 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RPS29P62273 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RPS29P62273 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RPS29P62273 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RPS29P62273 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
RPS29P62273 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RPS29P62273 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RPS29P62273 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RPS29P62273 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RPS29P62273 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPS29P62273 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPS29P62273 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPS29P62273 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPS29P62273 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPS29P62273 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPS29P62273 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPS29P62273 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPS29P62273 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPS29P62273 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPS29P62273 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPS29P62273 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPS29P62273 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPS29P62273 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RPS29P62273 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RPS29P62273 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RPS29P62273 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RPS29P62273 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPS29P62273 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPS29P62273 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPS29P62273 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPS29P62273 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPS29P62273 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPS29P62273 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPS29P62273 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RPS29P62273 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPS29P62273 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPS29P62273 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPS29P62273 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPS29P62273 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPS29P62273 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPS29P62273 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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