Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
UBE2HP62256 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBE2HP62256 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms