Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO4P61968 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO4P61968 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO4P61968 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO4P61968 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO4P61968 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO4P61968 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO4P61968 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO4P61968 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO4P61968 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO4P61968 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO4P61968 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO4P61968 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO4P61968 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO4P61968 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO4P61968 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO4P61968 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO4P61968 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO4P61968 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO4P61968 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO4P61968 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO4P61968 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO4P61968 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO4P61968 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO4P61968 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO4P61968 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO4P61968 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO4P61968 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO4P61968 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO4P61968 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO4P61968 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO4P61968 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO4P61968 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO4P61968 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO4P61968 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO4P61968 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO4P61968 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO4P61968 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO4P61968 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO4P61968 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO4P61968 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO4P61968 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO4P61968 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO4P61968 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO4P61968 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO4P61968 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO4P61968 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO4P61968 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO4P61968 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO4P61968 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO4P61968 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO4P61968 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO4P61968 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO4P61968 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO4P61968 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO4P61968 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO4P61968 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LMO4P61968 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LMO4P61968 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMO4P61968 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMO4P61968 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMO4P61968 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMO4P61968 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMO4P61968 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMO4P61968 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LMO4P61968 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMO4P61968 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LMO4P61968 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMO4P61968 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMO4P61968 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMO4P61968 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMO4P61968 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMO4P61968 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO4P61968 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO4P61968 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO4P61968 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO4P61968 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO4P61968 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO4P61968 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO4P61968 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO4P61968 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO4P61968 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO4P61968 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO4P61968 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO4P61968 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO4P61968 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO4P61968 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO4P61968 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO4P61968 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMO4P61968 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMO4P61968 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMO4P61968 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LMO4P61968 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMO4P61968 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMO4P61968 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMO4P61968 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMO4P61968 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMO4P61968 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMO4P61968 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMO4P61968 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms