Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1-1P60608 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms