Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
ROMO1P60602 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms