Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
EIF3EP60228 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3EP60228 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms