Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPI1P60174 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPI1P60174 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPI1P60174 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPI1P60174 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPI1P60174 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPI1P60174 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPI1P60174 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPI1P60174 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPI1P60174 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPI1P60174 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPI1P60174 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPI1P60174 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPI1P60174 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPI1P60174 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPI1P60174 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPI1P60174 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPI1P60174 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPI1P60174 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPI1P60174 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TPI1P60174 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPI1P60174 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPI1P60174 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPI1P60174 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPI1P60174 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPI1P60174 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPI1P60174 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPI1P60174 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPI1P60174 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPI1P60174 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPI1P60174 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPI1P60174 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPI1P60174 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPI1P60174 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPI1P60174 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPI1P60174 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPI1P60174 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPI1P60174 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPI1P60174 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPI1P60174 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPI1P60174 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPI1P60174 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPI1P60174 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TPI1P60174 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPI1P60174 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPI1P60174 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPI1P60174 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TPI1P60174 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPI1P60174 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPI1P60174 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPI1P60174 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPI1P60174 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPI1P60174 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPI1P60174 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPI1P60174 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPI1P60174 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPI1P60174 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TPI1P60174 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TPI1P60174 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TPI1P60174 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPI1P60174 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPI1P60174 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPI1P60174 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPI1P60174 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TPI1P60174 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPI1P60174 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPI1P60174 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPI1P60174 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPI1P60174 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TPI1P60174 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPI1P60174 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPI1P60174 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPI1P60174 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPI1P60174 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPI1P60174 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TPI1P60174 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPI1P60174 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPI1P60174 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPI1P60174 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPI1P60174 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TPI1P60174 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPI1P60174 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TPI1P60174 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPI1P60174 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPI1P60174 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPI1P60174 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPI1P60174 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPI1P60174 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPI1P60174 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPI1P60174 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPI1P60174 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPI1P60174 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TPI1P60174 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TPI1P60174 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TPI1P60174 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPI1P60174 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPI1P60174 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPI1P60174 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPI1P60174 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPI1P60174 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms