Protein–RNA interactions for Protein: P59990

KRTAP12-1, Keratin-associated protein 12-1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP12-1P59990 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP12-1P59990 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP12-1P59990 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms