Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCDC1P59894 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCDC1P59894 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms