Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms