Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAG2P55895 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAG2P55895 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAG2P55895 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAG2P55895 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAG2P55895 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAG2P55895 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAG2P55895 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAG2P55895 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAG2P55895 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAG2P55895 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAG2P55895 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAG2P55895 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAG2P55895 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAG2P55895 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAG2P55895 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RAG2P55895 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAG2P55895 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAG2P55895 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAG2P55895 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAG2P55895 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAG2P55895 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAG2P55895 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAG2P55895 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAG2P55895 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAG2P55895 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAG2P55895 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAG2P55895 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAG2P55895 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAG2P55895 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAG2P55895 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAG2P55895 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAG2P55895 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAG2P55895 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAG2P55895 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAG2P55895 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAG2P55895 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAG2P55895 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAG2P55895 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RAG2P55895 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RAG2P55895 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAG2P55895 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAG2P55895 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAG2P55895 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAG2P55895 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAG2P55895 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAG2P55895 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAG2P55895 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAG2P55895 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAG2P55895 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RAG2P55895 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAG2P55895 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAG2P55895 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAG2P55895 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAG2P55895 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAG2P55895 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RAG2P55895 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAG2P55895 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAG2P55895 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAG2P55895 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAG2P55895 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAG2P55895 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAG2P55895 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAG2P55895 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAG2P55895 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAG2P55895 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAG2P55895 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAG2P55895 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAG2P55895 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAG2P55895 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAG2P55895 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAG2P55895 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAG2P55895 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAG2P55895 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAG2P55895 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAG2P55895 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAG2P55895 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAG2P55895 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAG2P55895 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAG2P55895 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAG2P55895 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RAG2P55895 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAG2P55895 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAG2P55895 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAG2P55895 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAG2P55895 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAG2P55895 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAG2P55895 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAG2P55895 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RAG2P55895 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAG2P55895 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAG2P55895 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAG2P55895 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAG2P55895 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAG2P55895 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAG2P55895 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAG2P55895 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAG2P55895 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAG2P55895 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAG2P55895 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms