Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CASP7P55210 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CASP7P55210 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASP7P55210 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASP7P55210 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASP7P55210 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CASP7P55210 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CASP7P55210 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASP7P55210 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CASP7P55210 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CASP7P55210 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CASP7P55210 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CASP7P55210 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CASP7P55210 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CASP7P55210 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASP7P55210 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASP7P55210 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASP7P55210 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASP7P55210 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASP7P55210 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASP7P55210 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASP7P55210 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASP7P55210 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASP7P55210 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASP7P55210 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASP7P55210 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASP7P55210 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CASP7P55210 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CASP7P55210 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CASP7P55210 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CASP7P55210 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CASP7P55210 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CASP7P55210 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CASP7P55210 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CASP7P55210 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CASP7P55210 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CASP7P55210 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CASP7P55210 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CASP7P55210 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CASP7P55210 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CASP7P55210 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CASP7P55210 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CASP7P55210 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CASP7P55210 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CASP7P55210 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CASP7P55210 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CASP7P55210 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CASP7P55210 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CASP7P55210 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CASP7P55210 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CASP7P55210 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CASP7P55210 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CASP7P55210 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CASP7P55210 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CASP7P55210 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CASP7P55210 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CASP7P55210 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CASP7P55210 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CASP7P55210 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASP7P55210 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASP7P55210 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASP7P55210 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASP7P55210 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASP7P55210 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASP7P55210 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASP7P55210 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CASP7P55210 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASP7P55210 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASP7P55210 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASP7P55210 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASP7P55210 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASP7P55210 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASP7P55210 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASP7P55210 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CASP7P55210 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASP7P55210 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASP7P55210 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASP7P55210 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASP7P55210 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASP7P55210 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASP7P55210 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASP7P55210 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASP7P55210 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASP7P55210 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASP7P55210 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASP7P55210 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASP7P55210 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASP7P55210 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASP7P55210 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CASP7P55210 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASP7P55210 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASP7P55210 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASP7P55210 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASP7P55210 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASP7P55210 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASP7P55210 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CASP7P55210 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASP7P55210 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASP7P55210 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASP7P55210 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms