Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRPF1P55201 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
BRPF1P55201 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms