Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AQP4P55087 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AQP4P55087 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AQP4P55087 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AQP4P55087 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AQP4P55087 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AQP4P55087 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AQP4P55087 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AQP4P55087 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AQP4P55087 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AQP4P55087 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AQP4P55087 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AQP4P55087 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AQP4P55087 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AQP4P55087 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AQP4P55087 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AQP4P55087 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AQP4P55087 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AQP4P55087 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AQP4P55087 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
AQP4P55087 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
AQP4P55087 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
AQP4P55087 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
AQP4P55087 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
AQP4P55087 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
AQP4P55087 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AQP4P55087 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
AQP4P55087 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AQP4P55087 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AQP4P55087 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AQP4P55087 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AQP4P55087 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AQP4P55087 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AQP4P55087 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AQP4P55087 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AQP4P55087 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AQP4P55087 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AQP4P55087 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AQP4P55087 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AQP4P55087 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AQP4P55087 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AQP4P55087 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AQP4P55087 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AQP4P55087 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AQP4P55087 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
AQP4P55087 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AQP4P55087 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AQP4P55087 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AQP4P55087 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AQP4P55087 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AQP4P55087 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AQP4P55087 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AQP4P55087 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AQP4P55087 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AQP4P55087 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
AQP4P55087 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AQP4P55087 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AQP4P55087 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AQP4P55087 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AQP4P55087 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AQP4P55087 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AQP4P55087 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AQP4P55087 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AQP4P55087 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AQP4P55087 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AQP4P55087 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AQP4P55087 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AQP4P55087 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AQP4P55087 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
AQP4P55087 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AQP4P55087 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AQP4P55087 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AQP4P55087 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AQP4P55087 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AQP4P55087 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AQP4P55087 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AQP4P55087 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AQP4P55087 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AQP4P55087 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AQP4P55087 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AQP4P55087 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AQP4P55087 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AQP4P55087 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AQP4P55087 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AQP4P55087 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AQP4P55087 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AQP4P55087 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AQP4P55087 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AQP4P55087 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AQP4P55087 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AQP4P55087 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AQP4P55087 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AQP4P55087 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AQP4P55087 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AQP4P55087 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AQP4P55087 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AQP4P55087 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AQP4P55087 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AQP4P55087 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AQP4P55087 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms