Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAPAP54920 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAPAP54920 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAPAP54920 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAPAP54920 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAPAP54920 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAPAP54920 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAPAP54920 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAPAP54920 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAPAP54920 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAPAP54920 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAPAP54920 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAPAP54920 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAPAP54920 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAPAP54920 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAPAP54920 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAPAP54920 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAPAP54920 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAPAP54920 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NAPAP54920 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NAPAP54920 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NAPAP54920 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NAPAP54920 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NAPAP54920 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NAPAP54920 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NAPAP54920 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NAPAP54920 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NAPAP54920 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NAPAP54920 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NAPAP54920 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NAPAP54920 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NAPAP54920 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NAPAP54920 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NAPAP54920 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NAPAP54920 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NAPAP54920 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NAPAP54920 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NAPAP54920 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NAPAP54920 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NAPAP54920 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NAPAP54920 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NAPAP54920 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NAPAP54920 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NAPAP54920 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NAPAP54920 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NAPAP54920 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NAPAP54920 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NAPAP54920 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NAPAP54920 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NAPAP54920 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NAPAP54920 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NAPAP54920 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NAPAP54920 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NAPAP54920 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NAPAP54920 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NAPAP54920 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NAPAP54920 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NAPAP54920 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NAPAP54920 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NAPAP54920 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NAPAP54920 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NAPAP54920 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NAPAP54920 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NAPAP54920 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NAPAP54920 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NAPAP54920 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NAPAP54920 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NAPAP54920 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NAPAP54920 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NAPAP54920 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NAPAP54920 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NAPAP54920 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NAPAP54920 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NAPAP54920 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NAPAP54920 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NAPAP54920 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NAPAP54920 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NAPAP54920 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NAPAP54920 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NAPAP54920 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NAPAP54920 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NAPAP54920 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAPAP54920 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAPAP54920 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAPAP54920 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAPAP54920 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAPAP54920 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAPAP54920 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAPAP54920 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAPAP54920 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAPAP54920 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAPAP54920 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAPAP54920 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAPAP54920 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAPAP54920 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAPAP54920 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAPAP54920 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAPAP54920 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NAPAP54920 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NAPAP54920 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms