Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GYS2P54840 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GYS2P54840 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GYS2P54840 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GYS2P54840 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GYS2P54840 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GYS2P54840 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GYS2P54840 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GYS2P54840 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GYS2P54840 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GYS2P54840 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GYS2P54840 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GYS2P54840 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GYS2P54840 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GYS2P54840 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GYS2P54840 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GYS2P54840 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GYS2P54840 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GYS2P54840 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GYS2P54840 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GYS2P54840 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GYS2P54840 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GYS2P54840 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GYS2P54840 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GYS2P54840 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GYS2P54840 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GYS2P54840 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GYS2P54840 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GYS2P54840 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GYS2P54840 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GYS2P54840 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GYS2P54840 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GYS2P54840 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GYS2P54840 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GYS2P54840 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GYS2P54840 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GYS2P54840 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GYS2P54840 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GYS2P54840 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GYS2P54840 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GYS2P54840 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GYS2P54840 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GYS2P54840 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GYS2P54840 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GYS2P54840 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GYS2P54840 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GYS2P54840 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GYS2P54840 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GYS2P54840 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GYS2P54840 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GYS2P54840 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GYS2P54840 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GYS2P54840 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYS2P54840 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYS2P54840 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYS2P54840 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYS2P54840 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYS2P54840 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYS2P54840 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYS2P54840 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYS2P54840 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYS2P54840 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYS2P54840 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYS2P54840 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYS2P54840 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYS2P54840 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYS2P54840 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYS2P54840 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYS2P54840 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYS2P54840 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYS2P54840 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYS2P54840 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYS2P54840 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GYS2P54840 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GYS2P54840 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GYS2P54840 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GYS2P54840 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GYS2P54840 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GYS2P54840 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GYS2P54840 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYS2P54840 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYS2P54840 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYS2P54840 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYS2P54840 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYS2P54840 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYS2P54840 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYS2P54840 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYS2P54840 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYS2P54840 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYS2P54840 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYS2P54840 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYS2P54840 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYS2P54840 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYS2P54840 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYS2P54840 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYS2P54840 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYS2P54840 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYS2P54840 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYS2P54840 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYS2P54840 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms