Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHA4P54764 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHA4P54764 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms