Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 YFT2YDR319C 825 nt5.01□□□□□ -1.61
HEF3P53978 SNM1YDR478W 597 nt5.01□□□□□ -1.61
HEF3P53978 YJL218WYJL218W 591 nt5.01□□□□□ -1.61
HEF3P53978 YLL017WYLL017W 312 nt5.01□□□□□ -1.61
HEF3P53978 YBL029WYBL029W 1131 nt5.01□□□□□ -1.61
HEF3P53978 RPL18BYNL301C 561 nt5.01□□□□□ -1.61
HEF3P53978 YNR061CYNR061C 660 nt5.01□□□□□ -1.61
HEF3P53978 KIC1YHR102W 3243 nt5.01□□□□□ -1.61
HEF3P53978 YDL094CYDL094C 510 nt5□□□□□ -1.61
HEF3P53978 YDR133CYDR133C 336 nt5□□□□□ -1.61
HEF3P53978 BUD16YEL029C 939 nt5□□□□□ -1.61
HEF3P53978 FUR1YHR128W 651 nt5□□□□□ -1.61
HEF3P53978 IGO2YHR132W-A 396 nt5□□□□□ -1.61
HEF3P53978 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5□□□□□ -1.61
HEF3P53978 PPA2YMR267W 933 nt5□□□□□ -1.61
HEF3P53978 SRB6YBR253W 366 nt5□□□□□ -1.61
HEF3P53978 TOG1YER184C 2385 nt5□□□□□ -1.61
HEF3P53978 STE12YHR084W 2067 nt5□□□□□ -1.61
HEF3P53978 MET17YLR303W 1335 nt4.99□□□□□ -1.61
HEF3P53978 PHO84YML123C 1764 nt4.99□□□□□ -1.61
HEF3P53978 PRE9YGR135W 777 nt4.99□□□□□ -1.61
HEF3P53978 CWH43YCR017C 2862 nt4.99□□□□□ -1.61
HEF3P53978 DXO1YDR370C 1329 nt4.98□□□□□ -1.61
HEF3P53978 SAS4YDR181C 1446 nt4.98□□□□□ -1.61
HEF3P53978 SNF3YDL194W 2655 nt4.98□□□□□ -1.61
HEF3P53978 NBP2YDR162C 711 nt4.98□□□□□ -1.61
HEF3P53978 ECM1YAL059W 639 nt4.98□□□□□ -1.61
HEF3P53978 YLR346CYLR346C 306 nt4.98□□□□□ -1.61
HEF3P53978 YOR292CYOR292C 930 nt4.98□□□□□ -1.61
HEF3P53978 PRP43YGL120C 2304 nt4.98□□□□□ -1.61
HEF3P53978 MAD3YJL013C 1548 nt4.97□□□□□ -1.61
HEF3P53978 MET3YJR010W 1536 nt4.97□□□□□ -1.61
HEF3P53978 RIA1YNL163C 3333 nt4.97□□□□□ -1.61
HEF3P53978 FMP48YGR052W 1110 nt4.97□□□□□ -1.61
HEF3P53978 GTR1YML121W 933 nt4.97□□□□□ -1.61
HEF3P53978 SIW14YNL032W 846 nt4.97□□□□□ -1.61
HEF3P53978 NCE103YNL036W 666 nt4.97□□□□□ -1.61
HEF3P53978 ARR1YPR199C 885 nt4.97□□□□□ -1.61
HEF3P53978 PTA1YAL043C 2358 nt4.97□□□□□ -1.61
HEF3P53978 MCM4YPR019W 2802 nt4.96□□□□□ -1.61
HEF3P53978 PXA1YPL147W 2613 nt4.96□□□□□ -1.61
HEF3P53978 SPO74YGL170C 1242 nt4.96□□□□□ -1.62
HEF3P53978 ATG1YGL180W 2694 nt4.96□□□□□ -1.62
HEF3P53978 VBA2YBR293W 1425 nt4.96□□□□□ -1.62
HEF3P53978 NFI1YOR156C 2181 nt4.95□□□□□ -1.62
HEF3P53978 APL6YGR261C 2430 nt4.95□□□□□ -1.62
HEF3P53978 KIN4YOR233W 2403 nt4.95□□□□□ -1.62
HEF3P53978 ATH1YPR026W 3636 nt4.95□□□□□ -1.62
HEF3P53978 NTA1YJR062C 1374 nt4.95□□□□□ -1.62
HEF3P53978 MPC54YOR177C 1395 nt4.95□□□□□ -1.62
HEF3P53978 SEC9YGR009C 1956 nt4.95□□□□□ -1.62
HEF3P53978 YCF1YDR135C 4548 nt4.95□□□□□ -1.62
HEF3P53978 GLE2YER107C 1098 nt4.95□□□□□ -1.62
HEF3P53978 ZRT1YGL255W 1131 nt4.95□□□□□ -1.62
HEF3P53978 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt4.95□□□□□ -1.62
HEF3P53978 VTA1YLR181C 993 nt4.95□□□□□ -1.62
HEF3P53978 PEX12YMR026C 1200 nt4.95□□□□□ -1.62
HEF3P53978 SPC24YMR117C 642 nt4.95□□□□□ -1.62
HEF3P53978 YPL113CYPL113C 1191 nt4.95□□□□□ -1.62
HEF3P53978 NCR1YPL006W 3513 nt4.95□□□□□ -1.62
HEF3P53978 PMC1YGL006W 3522 nt4.94□□□□□ -1.62
HEF3P53978 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt4.94□□□□□ -1.62
HEF3P53978 YKL169CYKL169C 384 nt4.94□□□□□ -1.62
HEF3P53978 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt4.94□□□□□ -1.62
HEF3P53978 SIS2YKR072C 1689 nt4.93□□□□□ -1.62
HEF3P53978 snR57snR57 88 nt4.93□□□□□ -1.62
HEF3P53978 ARP10YDR106W 855 nt4.93□□□□□ -1.62
HEF3P53978 INO2YDR123C 915 nt4.93□□□□□ -1.62
HEF3P53978 KEX1YGL203C 2190 nt4.93□□□□□ -1.62
HEF3P53978 YGR011WYGR011W 327 nt4.93□□□□□ -1.62
HEF3P53978 YHR112CYHR112C 1137 nt4.93□□□□□ -1.62
HEF3P53978 ISA1YLL027W 753 nt4.93□□□□□ -1.62
HEF3P53978 YLR402WYLR402W 192 nt4.93□□□□□ -1.62
HEF3P53978 VPS36YLR417W 1701 nt4.93□□□□□ -1.62
HEF3P53978 YOR289WYOR289W 756 nt4.93□□□□□ -1.62
HEF3P53978 GDT1YBR187W 843 nt4.93□□□□□ -1.62
HEF3P53978 BBC1YJL020C 3474 nt4.93□□□□□ -1.62
HEF3P53978 VPS73YGL104C 1461 nt4.93□□□□□ -1.62
HEF3P53978 GPR1YDL035C 2886 nt4.93□□□□□ -1.62
HEF3P53978 CHL1YPL008W 2586 nt4.93□□□□□ -1.62
HEF3P53978 ALG9YNL219C 1668 nt4.92□□□□□ -1.62
HEF3P53978 PCL9YDL179W 915 nt4.92□□□□□ -1.62
HEF3P53978 AHA1YDR214W 1053 nt4.92□□□□□ -1.62
HEF3P53978 YER134CYER134C 537 nt4.92□□□□□ -1.62
HEF3P53978 GPI12YMR281W 915 nt4.92□□□□□ -1.62
HEF3P53978 PWR1PWR1 941 nt4.92□□□□□ -1.62
HEF3P53978 snR34snR34 203 nt4.92□□□□□ -1.62
HEF3P53978 GSH2YOL049W 1476 nt4.92□□□□□ -1.62
HEF3P53978 PIM1YBL022C 3402 nt4.92□□□□□ -1.62
HEF3P53978 SRP72YPL210C 1923 nt4.91□□□□□ -1.62
HEF3P53978 VHC1YBR235W 3363 nt4.91□□□□□ -1.62
HEF3P53978 YHP1YDR451C 1062 nt4.91□□□□□ -1.62
HEF3P53978 RPL34AYER056C-A 366 nt4.91□□□□□ -1.62
HEF3P53978 RPL19AYBR084C-A 570 nt4.91□□□□□ -1.62
HEF3P53978 VHS2YIL135C 1311 nt4.91□□□□□ -1.62
HEF3P53978 SAP155YFR040W 3009 nt4.91□□□□□ -1.62
HEF3P53978 HRK1YOR267C 2280 nt4.9□□□□□ -1.62
HEF3P53978 ACE2YLR131C 2313 nt4.9□□□□□ -1.62
HEF3P53978 PCL8YPL219W 1479 nt4.9□□□□□ -1.62
HEF3P53978 LUC7YDL087C 786 nt4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 63.4 ms