Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	YPL199C	YPL199C	723 nt		4.49	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	HST1	YOL068C	1512 nt		4.49	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	SYP1	YCR030C	2613 nt		4.49	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	AKL1	YBR059C	3327 nt		4.49	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	RCK2	YLR248W	1833 nt		4.49	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	TAF7	YMR227C	1773 nt		4.48	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	BCK2	YER167W	2556 nt		4.48	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	MTR10	YOR160W	2919 nt		4.48	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	RMD5	YDR255C	1266 nt		4.48	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	DUO1	YGL061C	744 nt		4.48	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YHR137C-A	YHR137C-A	651 nt		4.48	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	DAN1	YJR150C	897 nt		4.48	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	RAD27	YKL113C	1149 nt		4.48	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YIM2	YMR151W	438 nt		4.48	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	LTO1	YNL260C	597 nt		4.48	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	CKB2	YOR039W	777 nt		4.48	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YNG1	YOR064C	660 nt		4.48	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YOR200W	YOR200W	399 nt		4.48	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	MRM1	YOR201C	1239 nt		4.48	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	MFM1	YPL060W	1242 nt		4.48	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	SMF1	YOL122C	1728 nt		4.48	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	SAT4	YCR008W	1812 nt		4.48	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	XKS1	YGR194C	1803 nt		4.48	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	VID28	YIL017C	2766 nt		4.48	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	PMC1	YGL006W	3522 nt		4.47	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	KGD1	YIL125W	3045 nt		4.47	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	SSH4	YKL124W	1740 nt		4.47	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	RTC5	YOR118W	1704 nt		4.47	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	RSC3	YDR303C	2658 nt		4.47	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YDL241W	YDL241W	372 nt		4.47	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YEL074W	YEL074W	339 nt		4.47	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YLR326W	YLR326W	723 nt		4.47	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	PRE7	YBL041W	726 nt		4.47	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	FAA1	YOR317W	2103 nt		4.47	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	SRB6	YBR253W	366 nt		4.47	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	SER33	YIL074C	1410 nt		4.46	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	MUP3	YHL036W	1641 nt		4.46	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	MET4	YNL103W	2019 nt		4.46	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	GLN4	YOR168W	2430 nt		4.46	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	MET12	YPL023C	1974 nt		4.46	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	LDB17	YDL146W	1476 nt		4.46	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	NAT2	YGR147C	867 nt		4.46	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	BIO2	YGR286C	1128 nt		4.46	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	YIL152W	YIL152W	708 nt		4.46	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	ATP14	YLR295C	375 nt		4.46	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	YOL024W	YOL024W	519 nt		4.46	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	YPR169W-A	YPR169W-A	219 nt		4.46	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	YPR170W-B	YPR170W-B	258 nt		4.46	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	BUD7	YOR299W	2241 nt		4.46	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	VHS3	YOR054C	2025 nt		4.46	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	NHX1	YDR456W	1902 nt		4.46	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	TDA6	YPR157W	1404 nt		4.46	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	BDP1	YNL039W	1785 nt		4.45	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	DIP2	YLR129W	2832 nt		4.45	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	RPS11A	YDR025W	471 nt		4.45	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	SPR28	YDR218C	1272 nt		4.45	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	YNG2	YHR090C	849 nt		4.45	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	LNP1	YHR192W	837 nt		4.45	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	MHO1	YJR008W	1017 nt		4.45	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	YAR019W-A	YAR019W-A	333 nt		4.45	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	MLF3	YNL074C	1359 nt		4.44	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	PRM2	YIL037C	1971 nt		4.44	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	LPP1	YDR503C	825 nt		4.44	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	SAE3	YHR079C-A	276 nt		4.44	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	MRT4	YKL009W	711 nt		4.44	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	YRA2	YKL214C	612 nt		4.44	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	SLZ1	YNL196C	897 nt		4.44	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	RCL1	YOL010W	1104 nt		4.44	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	VPS28	YPL065W	729 nt		4.44	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	IDI1	YPL117C	867 nt		4.44	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	PMT4	YJR143C	2289 nt		4.44	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	ZRC1	YMR243C	1329 nt		4.44	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	APC4	YDR118W	1959 nt		4.44	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	ARG4	YHR018C	1392 nt		4.43	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	YDL109C	YDL109C	1944 nt		4.43	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	DON1	YDR273W	1098 nt		4.43	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	COS4	YFL062W	1140 nt		4.43	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	COX4	YGL187C	468 nt		4.43	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	NMD4	YLR363C	657 nt		4.43	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	YAP1802	YGR241C	1707 nt		4.43	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	RNY1	YPL123C	1305 nt		4.43	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	YER077C	YER077C	2067 nt		4.42	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	snR7-S	snR7-S	179 nt		4.42	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	AIM10	YER087W	1731 nt		4.42	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	YGL088W	YGL088W	366 nt		4.42	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	YAL047W-A	YAL047W-A	330 nt		4.42	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	SRP40	YKR092C	1221 nt		4.42	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	CUS2	YNL286W	858 nt		4.42	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	SEO1	YAL067C	1782 nt		4.42	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	YHL012W	YHL012W	1482 nt		4.42	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	MSC2	YDR205W	2175 nt		4.41	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	NSE3	YDR288W	912 nt		4.41	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	CYC1	YJR048W	330 nt		4.41	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	YLR225C	YLR225C	1224 nt		4.41	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	SWC7	YLR385C	399 nt		4.41	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	COS3	YML132W	1140 nt		4.41	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	YMR130W	YMR130W	909 nt		4.41	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	YPT53	YNL093W	663 nt		4.41	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	NAT3	YPR131C	588 nt		4.41	□□□□□ -1.7
DSL1	P53847	COS2	YBR302C	1140 nt		4.41	□□□□□ -1.7

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.6 ms