Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC5A3P53794 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A3P53794 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms