Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIMK1P53667 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms