Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THOP1P52888 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THOP1P52888 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THOP1P52888 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
THOP1P52888 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THOP1P52888 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THOP1P52888 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THOP1P52888 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THOP1P52888 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THOP1P52888 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THOP1P52888 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
THOP1P52888 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THOP1P52888 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THOP1P52888 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THOP1P52888 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THOP1P52888 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
THOP1P52888 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THOP1P52888 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THOP1P52888 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THOP1P52888 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THOP1P52888 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THOP1P52888 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THOP1P52888 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THOP1P52888 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THOP1P52888 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THOP1P52888 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THOP1P52888 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THOP1P52888 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THOP1P52888 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
THOP1P52888 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
THOP1P52888 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
THOP1P52888 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
THOP1P52888 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
THOP1P52888 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THOP1P52888 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THOP1P52888 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THOP1P52888 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THOP1P52888 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THOP1P52888 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THOP1P52888 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THOP1P52888 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THOP1P52888 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THOP1P52888 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THOP1P52888 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THOP1P52888 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THOP1P52888 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THOP1P52888 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THOP1P52888 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THOP1P52888 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THOP1P52888 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THOP1P52888 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THOP1P52888 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THOP1P52888 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THOP1P52888 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THOP1P52888 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THOP1P52888 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THOP1P52888 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THOP1P52888 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THOP1P52888 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THOP1P52888 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THOP1P52888 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
THOP1P52888 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THOP1P52888 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THOP1P52888 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THOP1P52888 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
THOP1P52888 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
THOP1P52888 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THOP1P52888 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THOP1P52888 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THOP1P52888 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THOP1P52888 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THOP1P52888 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THOP1P52888 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THOP1P52888 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THOP1P52888 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THOP1P52888 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THOP1P52888 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
THOP1P52888 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THOP1P52888 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THOP1P52888 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
THOP1P52888 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THOP1P52888 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
THOP1P52888 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THOP1P52888 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THOP1P52888 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THOP1P52888 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THOP1P52888 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THOP1P52888 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
THOP1P52888 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
THOP1P52888 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THOP1P52888 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THOP1P52888 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THOP1P52888 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THOP1P52888 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THOP1P52888 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THOP1P52888 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THOP1P52888 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THOP1P52888 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THOP1P52888 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THOP1P52888 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms